Analyse scientifique avec Python

Utilisation de sys.argv

Le module sys permet un accès direct aux arguments de la ligne de commande, via la liste sys.argv : sys.argv[0] contient le nom du script exécuté, sys.argv[1] le nom du 1^er argument (s'il existe), etc. P.ex. :

# Gestion simplifiée d'un argument entier sur la ligne de commande
import sys

if sys.argv[1:]:  # Présence d'au moins un argument sur la ligne de commande
    try:
        n = int(sys.argv[1])  # Essayer de lire le 1er argument comme un entier
    except ValueError:
        raise ValueError("L'argument '{}' n'est pas un entier"
                         .format(sys.argv[1]))
else:                        # Pas d'argument sur la ligne de commande
    n = 101                  # Valeur par défaut

Module argparse

Pour une gestion avancée des arguments et/ou options de la ligne de commande, il est préférable d'utiliser le module argparse. P.ex. :

    import argparse

    parser = argparse.ArgumentParser(
        usage="%(prog)s [-p/--plot] [-i/--input coordfile | x1,y1 x2,y2 x3,y3]",
        description=__doc__)
    parser.add_argument('coords', nargs='*', type=str, metavar='x,y',
                        help="Coordinates of point")
    parser.add_argument('-i', '--input', nargs='?', type=file,
                        help="Coordinate file (one 'x,y' per line)")
    parser.add_argument('-p', '--plot', action="store_true", default=False,
                        help="Draw the circumscribed circle")
    parser.add_argument('--version', action='version', version=__version__)

    args = parser.parse_args()

Cette solution génère automatiquement une aide en ligne, p.ex. :

$ python circonscrit.py -h
usage: circonscrit.py [-p/--plot] [-i/--input coordfile | x1,y1 x2,y2 x3,y3]

Compute the circumscribed circle to 3 points in the plan.

positional arguments:
  x,y                   Coordinates 'x,y' of point

optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -i [INPUT], --input [INPUT]
                        Coordinate file (one 'x,y' per line)
  -p, --plot            Draw the circumscribed circle
  --version             show program's version number and exit

Les modules pickle/cPickle permettent la sauvegarde pérenne d'objets python (« sérialisation »).

>>> d = dict(a=1, b=2, c=3)
>>> l = range(10000)
>>> import cPickle as pickle         # 'cPickle' est + rapide que 'pickle'
>>> pkl = open('archive.pkl', 'w')   # Overture du fichier en écriture
>>> pickle.dump((d, l), pkl, protocol=-1)  # Sérialisation du tuple (d, l)
>>> pkl.close()                      # *IMPORTANT !* Fermeture du fichier
>>> d2, l2 = pickle.load(open('archive.pkl')) # Désérialisation (relecture)
>>> (d == d2) and (l == l2)
True

Quelques modules de la bibliothèque standard qui peuvent être d'intérêt :

• math : accès aux fonctions mathématiques réelles

   

  Sélectionnez

  >>> math.asin(math.sqrt(2) / 2) / math.pi * 180
  45.00000000000001

• cmath : accès aux fonctions mathématiques complexes

   

  Sélectionnez

  >>> cmath.exp(cmath.pi * 1j) + 1
  1.2246467991473532e-16j

• a ;

• collections définit de nouveaux types spécialisés, p.ex. collections.OrderedDict, un dictionnaire ordonné ;

• itertools fournit des générateurs de boucle (itérateurs) et de combinatoire :

>>> [ ''.join(item) for item in itertools.combinations('ABCD', 2) ]
['AB', 'AC', 'AD', 'BC', 'BD', 'CD']

• interactions avec le système :

  • sys, os : interface système,
  • shutil : opérations sur les fichiers (copy, move, etc.),
  • subprocess : exécution de commandes système,
  • glob : métacaractères du shell (p.ex. toto?.*) ;
• e : re ;
• gestion du temps (time) et des dates (datetime, calendar) ;
• fichiers compressés et archives : gzip, bz2, zipfile, tarfile ;

• Lecture et sauvegarde des données (outre pickle/cPickle) :

  • csv : lecture/sauvegarde de fichiers CSVComma Separated Values,
  • ConfigParser : fichiers de configuration,
  • json : lightweight data interchange format ;
• lecture d'une URL (p.ex. page web) : urllib2.

• TUIText User Interface : curses
• GUIGraphical User Interface : Tkinter,

bibliothèques externes :

• TUI : termcolor (texte coloré ANSII), https://pypi.python.org/pypi/blessed (mise en page)
• GUI : PyGI (GTK3), PyQt / pySide (Qt), wxPython (wxWidgets)